Затем последовал 3-й эпизод под названием "Пинки, Брейн... и Ларри", где на примере мышонка, названного в честь актёра Ларри Фаина из "Трёх марионеток" (и озвученного актёром Билли Уэстом, который на тот момент ещё и озвучивал кота Стимпи из мультсериала "Шоу Рена и Стимпи"), наглядно пытались показать, что Пинки и Брейн - это "инь и янь, а третий - всегда лишний". Мышонок Ларри, воспринимаемый Пинки и Брейном как типичный второстепенный герой шоу, намеренно испортил ритм эпизода и динамику персонажей, чтобы доказать руководству Уорнер Браззерс, что мыши лучше всего работают в дуэте. Но студия не поняла намёка и продолжила оказывать невыносимое и упорное давление на съёмочную группу. В итоге из Warner bros. уволился сценарист Питер Гастингс, высмеяв настойчивость руководителей в 55-м эпизоде третьего сезона под названием "Вы никогда больше не будете есть пищевые гранулы в этом городе". Здесь наглядно было показано, как малейшие и глупые изменения в сценарии в итоге портят культовый фильм и рушат карьеру актёров. В данном эпизоде напрямую затрагивалась проблема переоснащения сетей шоу, которые уже и так прекрасно работают.
Создатели выразили к этому своё отношение через монолог Брейна, который после очередной неудачи по захвату мира сделал собственный вывод о том, в чем же заключалась его ошибка:
"Брейн: Все дело в командной работе. Особая химия. Инь и Ян!
Ларри: и Ларри!
Брейн: Нет, это просто Инь и Ян, без всякого Ларри! (или: "Нет, есть только Инь и Ян! НЕ ДОЛЖНО БЫТЬ никакого Ларри!")
Пинки: Эгад, Брейн! Кто я - Инь или Ян?
Брейн: Не знаю, Пинки. Но он..... он - определенно Ларри!"
А затем последовал 4 сезон шоу, который заметно отличался от трёх предыдущих - мало того, что сюжет с глупым танцем под песню "Макарена" растянули на три серии, сделав очередную пародию на "Остров доктора Моро" Герберта Уэллса в финале, так ещё и спародировали "Звёздные войны" Джорджа Лукаса, где присутствовали уже все остальные персонажи "Озорных анимашек". И, если бы оба шоу не транслировали в один и тот же день, 14 ноября 1998 года, эпизод 4 сезона "Пинки и Брейна" под названием "Звездные Уорнеры" мог бы стать 100-й серией вселенной "Animaniacs". А потом Том Рюггер снял рождественский полнометражный анимационный фильм "Желание Вакко" в 1999 году, где Пинки и Брейн вновь были показаны эпизодически вместе с другими персонажами "Animaniacs", ищущими Звезду Желаний, и в финале один из них стал конюхом (Пинки), а другой - премьер-министром (Брейн). Казалось, на этом можно было бы официально закончить историю Пинки и Брейна, но вот руководство Warner bros. всё не унималось. Руководитель отдела Кристофер Кинен, видимо, был большим фанатом оригинальных "Tiny toon adventures" ("Приключений мультяшек"), и однажды ему на глаза попались два спецвыпуска, где лабораторные мыши эпизодически в качестве камео и шутки (особенно каламбура) ненадолго появились в доме Элмайры Дафф в качестве её питомцев. Именно он упросил сценаристов создать отдельный мультсериал с участием этой "любвеобильной" девчонки,
